108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0629 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0629  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0801  hypothetical protein  44.92 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.443403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2252  glutaredoxin 2  48.15 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.390766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2220  hypothetical protein  36.94 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.652614  normal  0.464187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2590  thioredoxin, putative  36.94 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2550  hypothetical protein  42.42 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00171003  hitchhiker  0.00000000117707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4007  hypothetical protein  34.38 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244111  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3557  hypothetical protein  37.96 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41910  hypothetical protein  36.11 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  23.81 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  30.49 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  25.24 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  28.85 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  27.71 
 
 		 106 aa  47.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  29.13 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  27.72 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  24.53 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  23.46 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0459  Thioredoxin domain protein  34.18 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0626  Thioredoxin domain protein  24.75 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1825  Thioredoxin domain protein  22.64 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  29.49 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  35.71 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0241  Thioredoxin domain protein  20.75 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.83806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4648  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4417  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4256  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4268  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4758  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4649  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4629  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0273149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0606  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4633  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  34.85 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  30.65 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  32.04 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf030  thioredoxin family member  31.75 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  30.38 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  26 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  27.38 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  32.5 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  29.11 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  30.12 
 
 		 165 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  30.61 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  21.35 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4349  thioredoxin  35.53 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  32.5 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  32.43 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  34.29 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  32.43 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  29.13 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1747  thioredoxin-related  30.86 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  34.92 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  24.49 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  29.13 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  28.38 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  28.57 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  22.99 
 
 		 107 aa  42  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  30.1 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  28.74 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  34.85 
 
 		 104 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  25.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 768 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  34.85 
 
 		 104 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  26.51 
 
 		 547 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  30.77 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  30.77 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  32.5 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  25.26 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  26.58 
 
 		 105 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  32.5 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  32.1 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  34.85 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  32.1 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  32.1 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  26.21 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  34.85 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2157  thioredoxin  25.25 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  32 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  25.3 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  21.95 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  28 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  32.39 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  28.16 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3221  thioredoxin  34.33 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2293  Thioredoxin domain  33.33 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.126467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  29.63 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  23.71 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  32.5 
 
 		 280 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1775  thioredoxin  30.14 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  24.53 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  27.06 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1746  thioredoxin domain-containing protein  28.04 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  25.61 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2808  predicted protein  29.17 
 
 		 272 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1972  Thioredoxin domain protein  28.04 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  27.14 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  26.15 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>