34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2590 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2590  thioredoxin, putative  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2220  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.652614  normal  0.464187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0629  hypothetical protein  36.94 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0801  hypothetical protein  29.73 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.443403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4007  hypothetical protein  30.91 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244111  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2252  glutaredoxin 2  29.73 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.390766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3557  hypothetical protein  35.78 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41910  hypothetical protein  35.78 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2550  hypothetical protein  37.23 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00171003  hitchhiker  0.00000000117707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  24.27 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  27.69 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  24.73 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  26.6 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  25.3 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  29.17 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4811  thioredoxin  25.76 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000349288  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  25 
 
 		 103 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  20 
 
 		 102 aa  42  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  28 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  27.5 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5095  putative thioredoxin  24.24 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4889  Thioredoxin domain protein  24.27 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5225  thioredoxin  24.24 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0101764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4714  thioredoxin  24.24 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000126236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  32.14 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4698  thioredoxin  24.24 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00082154  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4857  thioredoxin  24.24 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0192827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5131  putative thioredoxin  24.24 
 
 		 99 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  30.16 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 222 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  28.21 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0108  putative thioredoxin  24.24 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000133377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  24.04 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1847  putative thioredoxin  19.44 
 
 		 107 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000930987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>