83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1847 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1847  putative thioredoxin  100 
 
 		 107 aa  214  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000930987  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1567  putative thioredoxin  95.71 
 
 		 82 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  38.14 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  34.29 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2111  thioredoxin, putative  28.72 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  28.42 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  30.23 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0430  hypothetical protein  27.88 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0452  hypothetical protein  29.9 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0364  thioredoxin  28.87 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.968334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0500  hypothetical protein  27.88 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0361  thioredoxin  27.88 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4872  hypothetical protein  29.9 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  25 
 
 		 118 aa  57  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  25 
 
 		 118 aa  57  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0373  hypothetical protein  26.92 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0387  hypothetical protein  26.92 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  25.49 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  33.77 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  29.41 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  31.65 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  22.77 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  27.37 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  30.59 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  35.62 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  27.06 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  24.74 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  29.76 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  32.53 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1268  glutaredoxin 2  31.46 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  23.86 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  27.78 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  32.94 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  25 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  27.66 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  34.21 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  24.24 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  26.92 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  25.88 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  26.04 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  24.29 
 
 		 222 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0732  hypothetical protein  31.17 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  32 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  25.88 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  22.47 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  28.95 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  22.47 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  22.47 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  25.88 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4649  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  24.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  24.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  30.12 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  25.61 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  24.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  24.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  24.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  24.71 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  24.24 
 
 		 147 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  26.76 
 
 		 107 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  24.05 
 
 		 108 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  25.51 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  25.33 
 
 		 290 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  24.14 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  25.26 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  35 
 
 		 458 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  23.68 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  28.77 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  36.21 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  26.67 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  37.68 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4096  thioredoxin domain-containing protein  24.47 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  21.05 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  27.4 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  28.38 
 
 		 330 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  23.53 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2590  thioredoxin, putative  19.44 
 
 		 111 aa  40  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46280  thioredoxin f  36.67 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2220  hypothetical protein  19.44 
 
 		 111 aa  40  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.652614  normal  0.464187 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  24.69 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  24.69 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  21.78 
 
 		 119 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>