17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0732 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0732  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3546  hypothetical protein  76.92 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  71.25 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  70 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  65 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  66.25 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  65 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  65.38 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  56.41 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  49.35 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  31.17 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  32.91 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  29.11 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.05 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1847  putative thioredoxin  31.17 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000930987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  35.38 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  33.8 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>