107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1211 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  46.08 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  41.67 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  38.46 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  36.54 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  40.45 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  40.78 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  38.32 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3546  hypothetical protein  41.57 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  39.33 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  34.62 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  35.96 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  34.83 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  36.14 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0732  hypothetical protein  32.91 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  32.61 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  27.38 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1847  putative thioredoxin  31.65 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000930987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  25.23 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  25.29 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  26.19 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  27.63 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  30.49 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  27.63 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  24.46 
 
 		 570 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  29.49 
 
 		 280 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  20.88 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  20.88 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  23.26 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  23.26 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  33.33 
 
 		 287 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  22.83 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  21.98 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  20.79 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  21.95 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  30.23 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  26.19 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  26.19 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  29.81 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.4 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  22.86 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  32.56 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  27.27 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  30.43 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  29.76 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  24.76 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  27.37 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  29.07 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  31.4 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  27.78 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2669  thioredoxin domain-containing protein  27.54 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.237733  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  23.53 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  28.79 
 
 		 324 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  24.59 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  29.23 
 
 		 334 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  26.44 
 
 		 324 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  30.38 
 
 		 277 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  30.12 
 
 		 513 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  21.74 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0815  thioredoxin-related  26.25 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221245  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  28.89 
 
 		 229 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  19.57 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  22.64 
 
 		 107 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  24.04 
 
 		 119 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  25 
 
 		 115 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  20.88 
 
 		 106 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  20.65 
 
 		 107 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  26.19 
 
 		 106 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  21.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1139  Thioredoxin domain protein  22.86 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  31.82 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  28.42 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  27.71 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  27.69 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  26.25 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  26.58 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  30.23 
 
 		 290 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  27.59 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  27.59 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  20.45 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  30 
 
 		 460 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  29.73 
 
 		 286 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  26.09 
 
 		 458 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  26.09 
 
 		 458 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  26.51 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  25.93 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13151  putative thioredoxin reductase  23.19 
 
 		 458 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  32.47 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  32.47 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  21.7 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  24 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  31.43 
 
 		 453 aa  40  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  27.71 
 
 		 150 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  24.49 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  24 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  29.55 
 
 		 284 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  32.95 
 
 		 290 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  19.78 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  26.39 
 
 		 135 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  31.08 
 
 		 293 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>