More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2011 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
129 aa  268  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0459  Thioredoxin domain protein  58.33 
 
 
114 aa  133  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  54.37 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  54.37 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  54.13 
 
 
115 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1747  thioredoxin-related  55.88 
 
 
128 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0149  thioredoxin domain-containing protein  53.92 
 
 
128 aa  120  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.55638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  39.42 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  43.27 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  42.42 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  39.42 
 
 
107 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  45.98 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  38.46 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.63 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  41 
 
 
105 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  38.61 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  37.86 
 
 
108 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  39.8 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  39.22 
 
 
108 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  38.1 
 
 
112 aa  87.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  37.25 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  35.92 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  36.79 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  37 
 
 
107 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  37.14 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  36 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  37.38 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  36.63 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  42.11 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  39.36 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  34.62 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  37.62 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  36.19 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  34.62 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  34.29 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  37.21 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  37.21 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  36.63 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  36.63 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  36.63 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  37.21 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.29 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  41.38 
 
 
106 aa  84  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  41.38 
 
 
107 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  40.91 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  40.7 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  38.2 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  39.08 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  33.65 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  37.38 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  40.18 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  39.6 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  34.62 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  34.31 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  37.21 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  40.23 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  37.25 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  40.18 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  33.65 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  39.77 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  39.77 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  38.82 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  45.12 
 
 
301 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  36.73 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  34.91 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  35.83 
 
 
287 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  35.29 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  33.02 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  35.29 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  34.17 
 
 
293 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  36.54 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  35.29 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  44.44 
 
 
282 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  44.44 
 
 
282 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  33.64 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  45.12 
 
 
918 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  45 
 
 
282 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  38.82 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  35.85 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  35.19 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  43.02 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  37.08 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  37.08 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  38.61 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  43.9 
 
 
282 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  35.64 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  45 
 
 
282 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  45 
 
 
282 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  36.11 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  42.55 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  36 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>