160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0503 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 113 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  56.64 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  56.19 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  54.87 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  55.24 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3546  hypothetical protein  55.75 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  55.24 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  52.88 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  41.9 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  40.95 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0732  hypothetical protein  56.41 
 
 		 80 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  41.67 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.84 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  31.43 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  27 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  25.49 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  28.41 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  31.33 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  36 
 
 		 287 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  25.47 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  27.27 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.18 
 
 		 286 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  28.57 
 
 		 467 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  27.06 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  24.71 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  28.92 
 
 		 310 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  30.12 
 
 		 282 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  28.21 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  30.12 
 
 		 282 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  29.21 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  28.43 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0879  thioredoxin  26.09 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  27.85 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  30.12 
 
 		 302 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  20.95 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  24.72 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  25.96 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  28.41 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  31.03 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  28.38 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  28.38 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  29.27 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  24.71 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.77 
 
 		 280 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  28.09 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  30.86 
 
 		 297 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  24.68 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  22.83 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  26.92 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  26.92 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  24.71 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  31.96 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  31.96 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  30 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  30 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  27.4 
 
 		 338 aa  44.3  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  27.16 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  27.71 
 
 		 281 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  27.71 
 
 		 282 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  31.34 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  27.27 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  24.72 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  27.71 
 
 		 281 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  29.49 
 
 		 272 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  30 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  25.32 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  22.35 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  29.73 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  26.51 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  26.92 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  25.32 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  27.85 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  28.92 
 
 		 289 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  29.41 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  26.44 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  28.75 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  26.97 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  26.04 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  28.57 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  28.28 
 
 		 304 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  25.71 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  31.65 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  21.69 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  27.85 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  27.91 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  30.12 
 
 		 285 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  22.08 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  26.97 
 
 		 268 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  26.37 
 
 		 105 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  31.33 
 
 		 286 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  30.77 
 
 		 302 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  27.35 
 
 		 301 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  27.37 
 
 		 113 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  28.05 
 
 		 105 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  25.51 
 
 		 150 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  25.23 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>