49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2559 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  100 
 
 
122 aa  245  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  40 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0452  hypothetical protein  39.22 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0364  thioredoxin  39.18 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.968334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0430  hypothetical protein  39.18 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  38.14 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2111  thioredoxin, putative  35.16 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0361  thioredoxin  39.18 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4872  hypothetical protein  37.25 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0500  hypothetical protein  39.18 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0387  hypothetical protein  38.14 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0373  hypothetical protein  38.14 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  30.93 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  30.93 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  37.76 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  47.76 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  40.58 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1268  glutaredoxin 2  35.44 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  41.18 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.18 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0524  Thioredoxin domain protein  32.47 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  30.61 
 
 
110 aa  50.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1847  putative thioredoxin  22.77 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000930987  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  26.14 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  36.84 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  25.51 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  24.71 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  27 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  25.61 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  28 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1385  Thioredoxin domain protein  29.03 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  27.45 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  33.75 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  25.84 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  25.68 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  23.53 
 
 
109 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 
120 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  30.49 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  30.67 
 
 
107 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  28.92 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  26.44 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  26.51 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  34.43 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  23.53 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  28.38 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  26.47 
 
 
105 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>