61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0405 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  368  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  70.79 
 
 		 179 aa  268  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  69.49 
 
 		 178 aa  264  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  68.54 
 
 		 178 aa  262  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  68.54 
 
 		 178 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  69.49 
 
 		 178 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  68.54 
 
 		 178 aa  258  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  67.98 
 
 		 178 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  67.98 
 
 		 178 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  66.29 
 
 		 178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  66.29 
 
 		 178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  66.29 
 
 		 178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  65.17 
 
 		 178 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  65.03 
 
 		 200 aa  248  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  65.17 
 
 		 178 aa  241  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  47.69 
 
 		 135 aa  140  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  37.93 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  38.14 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  32.68 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  28.15 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  40.3 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  32.22 
 
 		 104 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  34.67 
 
 		 109 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  35.21 
 
 		 124 aa  47.8  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  34.12 
 
 		 127 aa  47.8  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  30.88 
 
 		 104 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29280  putative thioredoxin  28.43 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  45.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  30.86 
 
 		 127 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  32.39 
 
 		 95 aa  45.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3969  putative thioredoxin  26.47 
 
 		 108 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  32.94 
 
 		 104 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  29.76 
 
 		 768 aa  44.7  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  39.47 
 
 		 106 aa  44.7  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  32.14 
 
 		 98 aa  44.3  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  32.31 
 
 		 91 aa  44.3  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  33.33 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  32.89 
 
 		 104 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  31.25 
 
 		 406 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  32.84 
 
 		 103 aa  42.4  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  42.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.29 
 
 		 104 aa  42.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  35.9 
 
 		 109 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2827  hypothetical protein  29.89 
 
 		 207 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  28.41 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  30.86 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  34.62 
 
 		 109 aa  41.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  26.39 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.86 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  33.33 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  28.92 
 
 		 140 aa  41.6  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  25.77 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  29.29 
 
 		 108 aa  41.2  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06140  expressed protein  30.12 
 
 		 119 aa  41.2  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  27.87 
 
 		 194 aa  40.8  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  40.8  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  29.63 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  23.85 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  27.27 
 
 		 148 aa  40.8  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>