29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2827 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2827  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  437  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5973  hypothetical protein  53.72 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3348  hypothetical protein  50.81 
 
 		 187 aa  205  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0850348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3340  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.965688  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3780  hypothetical protein  45 
 
 		 182 aa  177  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.41238  normal  0.142422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4036  hypothetical protein  35.33 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1281  hypothetical protein  37.06 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04560  hypothetical protein  34.04 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0483659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0571  hypothetical protein  33.87 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2011  thioredoxin-like protein  29.02 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.113065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3573  hypothetical protein  34.75 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140282  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1366  hypothetical protein  34.38 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.719632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1475  hypothetical protein  42.31 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1297  hypothetical protein  42.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1437  hypothetical protein  42.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1543  hypothetical protein  42.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0188875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1404  hypothetical protein  42.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1271  thioredoxin  42.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0361356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1269  thioredoxin  42.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.517108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1504  hypothetical protein  42.31 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1111  hypothetical protein  32.2 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.691511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3907  hypothetical protein  41.03 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1307  thioredoxin  39.74 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2019  hypothetical protein  37.97 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.303604  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1986  hypothetical protein  37.97 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0820  hypothetical protein  26.83 
 
 		 161 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  29.52 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  29.89 
 
 		 177 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2776  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  34 
 
 		 162 aa  41.6  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>