72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3212 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  79.78 
 
 		 178 aa  297  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  78.09 
 
 		 178 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  78.09 
 
 		 178 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  78.09 
 
 		 178 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  78.09 
 
 		 178 aa  296  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  78.65 
 
 		 178 aa  295  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  78.65 
 
 		 178 aa  295  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  78.09 
 
 		 178 aa  295  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  77.53 
 
 		 178 aa  293  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  75.28 
 
 		 179 aa  283  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  73.6 
 
 		 178 aa  279  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  74.01 
 
 		 178 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  65.03 
 
 		 200 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  65.17 
 
 		 177 aa  241  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  46.56 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  40.85 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  33.33 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  28.46 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  28.41 
 
 		 104 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  33.33 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  35.37 
 
 		 124 aa  48.5  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  36.96 
 
 		 106 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  24.67 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29.67 
 
 		 109 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  34.09 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  24 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  31.4 
 
 		 107 aa  45.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  31.91 
 
 		 108 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  34.48 
 
 		 104 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  33.73 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3706  thioredoxin domain-containing protein  37.5 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  25 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  32.58 
 
 		 124 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  29.89 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  31.03 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  28.89 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  28.89 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  23.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  28.89 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  28.89 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  28.89 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  28.89 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  28.41 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  31.4 
 
 		 104 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  30.49 
 
 		 106 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  28.77 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  28.41 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  29.89 
 
 		 104 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  28.26 
 
 		 104 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  31.25 
 
 		 104 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  34.25 
 
 		 105 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  28.26 
 
 		 104 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  34.25 
 
 		 105 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  28.26 
 
 		 104 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  28.26 
 
 		 104 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  30.56 
 
 		 104 aa  41.6  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  30.56 
 
 		 104 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.07 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  30.56 
 
 		 104 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  23.39 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  30.56 
 
 		 104 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  30.56 
 
 		 104 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2606  putative thioredoxin-like protein  28.74 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.888104  normal  0.656305 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  31.82 
 
 		 108 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  31.82 
 
 		 108 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  28.36 
 
 		 95 aa  41.2  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  34.12 
 
 		 127 aa  40.8  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.31 
 
 		 194 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>