29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2993 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  247  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  85.37 
 
 
124 aa  215  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  59.84 
 
 
127 aa  149  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  61.98 
 
 
124 aa  148  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  57.72 
 
 
127 aa  104  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  33.65 
 
 
200 aa  53.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  37.5 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  32.56 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  33.78 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  33.78 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  32.43 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  26.88 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  35.14 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  32.43 
 
 
178 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  32.94 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  37.21 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  35.9 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  30.11 
 
 
145 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  31.76 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  28.17 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  30.11 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  33.33 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  27.84 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>