67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3612 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  98.31 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  94.38 
 
 		 178 aa  348  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  89.33 
 
 		 178 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  89.89 
 
 		 178 aa  342  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  89.33 
 
 		 178 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  89.33 
 
 		 178 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  88.76 
 
 		 178 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  76.97 
 
 		 178 aa  297  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  78.65 
 
 		 178 aa  295  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  75.28 
 
 		 179 aa  293  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  75.71 
 
 		 178 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  71.04 
 
 		 200 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  67.98 
 
 		 177 aa  256  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  49.62 
 
 		 135 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  41.27 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  33.64 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  33.33 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  32.33 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  37.31 
 
 		 124 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  33.71 
 
 		 104 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  30.67 
 
 		 104 aa  47.8  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  36.62 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  35.87 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  33.78 
 
 		 123 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29.33 
 
 		 109 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  31.33 
 
 		 108 aa  45.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  34.21 
 
 		 104 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  31.94 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  30.95 
 
 		 108 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06140  expressed protein  32.35 
 
 		 119 aa  44.3  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  25.44 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  31.71 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3573  hypothetical protein  24.64 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140282  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1359  hypothetical protein  32.47 
 
 		 127 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  27.71 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  30.49 
 
 		 106 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 		 187 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  30.77 
 
 		 108 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  30.99 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  30.77 
 
 		 108 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  32.94 
 
 		 127 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  32.95 
 
 		 98 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  31.82 
 
 		 406 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  26.42 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.38 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  34.65 
 
 		 104 aa  41.2  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  35.62 
 
 		 109 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.87 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  24.19 
 
 		 220 aa  41.2  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  31.94 
 
 		 106 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  28.4 
 
 		 107 aa  41.2  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  29.55 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  32.93 
 
 		 105 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  32.93 
 
 		 105 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48320  hypothetical protein  28.18 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141732  normal  0.0691687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  30.12 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  30.12 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  30.12 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  30.12 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  31.88 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  30.56 
 
 		 106 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  30.12 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  30.12 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  30.12 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  30.12 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>