40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0463 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0463  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3430  hypothetical protein  69.95 
 
 		 178 aa  275  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0409  hypothetical protein  71.04 
 
 		 178 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0412  hypothetical protein  72.13 
 
 		 178 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0413  hypothetical protein  71.04 
 
 		 178 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3612  hypothetical protein  71.04 
 
 		 178 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3874  hypothetical protein  68.31 
 
 		 178 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4067  hypothetical protein  68.31 
 
 		 178 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3926  hypothetical protein  68.31 
 
 		 178 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0342  hypothetical protein  69.23 
 
 		 178 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3949  thioredoxin domain-containing protein  67.76 
 
 		 178 aa  264  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0517  hypothetical protein  66.67 
 
 		 178 aa  258  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  65.57 
 
 		 179 aa  255  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3212  hypothetical protein  65.03 
 
 		 178 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0405  hypothetical protein  65.03 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0451  hypothetical protein  45.04 
 
 		 135 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  35.92 
 
 		 162 aa  98.6  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0945  hypothetical protein  30.99 
 
 		 175 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12108  putative thioredoxin family protein  32.46 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.247091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0443  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0508  Thioredoxin domain protein  43.28 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0481603  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1675  hypothetical protein  37.78 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2993  hypothetical protein  33.65 
 
 		 123 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  30.86 
 
 		 109 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  34.78 
 
 		 104 aa  48.1  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48320  hypothetical protein  32.29 
 
 		 167 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141732  normal  0.0691687 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2311  hypothetical protein  29.37 
 
 		 127 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770151  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  32.22 
 
 		 146 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  40.74 
 
 		 104 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  30.39 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  34.48 
 
 		 104 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  34.52 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  30.85 
 
 		 108 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06140  expressed protein  30.88 
 
 		 119 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  26.97 
 
 		 106 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  32.47 
 
 		 447 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  35.53 
 
 		 104 aa  42  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  27.71 
 
 		 88 aa  42  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  33.7 
 
 		 165 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  29.41 
 
 		 104 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>