18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4261 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  77.44 
 
 		 134 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  75.94 
 
 		 132 aa  200  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  53.72 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  55 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  45.97 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  48.42 
 
 		 95 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  49.44 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4147  SoxS  48.42 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2430  SoxS  40.82 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  29.59 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3718  thioredoxin-related protein-like protein  25.4 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  29.89 
 
 		 446 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4106  hypothetical protein  41.79 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.475572  normal  0.0367818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  29.41 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2272  peptide methionine sulfoxide reductase  29.89 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  34.29 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0783  peptide methionine sulfoxide reductase  30.1 
 
 		 444 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>