15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1526 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  247  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  56.2 
 
 
134 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  53.72 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  54.55 
 
 
124 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  58.51 
 
 
132 aa  121  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  51.11 
 
 
95 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  51.72 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  41.23 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4147  SoxS  46.24 
 
 
127 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2430  SoxS  45.36 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  35.87 
 
 
446 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2272  peptide methionine sulfoxide reductase  35.23 
 
 
418 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0783  peptide methionine sulfoxide reductase  36.78 
 
 
444 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  26.6 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3718  thioredoxin-related protein-like protein  25.38 
 
 
145 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>