14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3921 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4147  SoxS  63.04 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  52.81 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  49.09 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  46.55 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  46.96 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  50.53 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  48.91 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2430  SoxS  50.53 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  49.43 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0783  peptide methionine sulfoxide reductase  36.26 
 
 		 444 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  32.61 
 
 		 446 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  28.89 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2272  peptide methionine sulfoxide reductase  33 
 
 		 418 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>