14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4154 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  100 
 
 		 95 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  51.11 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  49.47 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  48.91 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  45.26 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4147  SoxS  55.56 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  46.32 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  50.62 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2430  SoxS  46.67 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  34.52 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0783  peptide methionine sulfoxide reductase  34.15 
 
 		 444 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  34.15 
 
 		 446 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2272  peptide methionine sulfoxide reductase  33.73 
 
 		 418 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>