15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4966 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  77.44 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  68.42 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  56.2 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  50.94 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  49.47 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4147  SoxS  50.53 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  50.56 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  45.92 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2430  SoxS  37.37 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  28.16 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  32.18 
 
 		 446 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2272  peptide methionine sulfoxide reductase  34 
 
 		 418 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0783  peptide methionine sulfoxide reductase  32.18 
 
 		 444 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3718  thioredoxin-related protein-like protein  24.79 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>