13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3667 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  100 
 
 		 124 aa  248  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  54.55 
 
 		 124 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  50.94 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  54.84 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  54.17 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4147  SoxS  50.53 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  46.32 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  42.37 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2430  SoxS  43.88 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  23.3 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0783  peptide methionine sulfoxide reductase  31.33 
 
 		 444 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2272  peptide methionine sulfoxide reductase  30.49 
 
 		 418 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>