11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2430 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2430  SoxS  100 
 
 		 119 aa  234  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  43.24 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  46.67 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  46.67 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  37.93 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  43.88 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4147  SoxS  46.24 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  38.05 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  28.72 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>