11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2810 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4147  SoxS  58.33 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  53.41 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  48.91 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  45.92 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  41.23 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  42.37 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  41.32 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  50.62 
 
 		 95 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2430  SoxS  46.39 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  27 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>