11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0622 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  286  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  34.52 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  31.4 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  26.36 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  26.98 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4147  SoxS  32.22 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  26.92 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  28.89 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  23.3 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2430  SoxS  28.72 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>