13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4147 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4147  SoxS  100 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  55.26 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  62.22 
 
 		 135 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  48.67 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  55.56 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  48.39 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  46.36 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  45.26 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2430  SoxS  47 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  32.22 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0783  peptide methionine sulfoxide reductase  30.77 
 
 		 444 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  32.18 
 
 		 446 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>