More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0783 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0783  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
444 aa  926    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2272  peptide methionine sulfoxide reductase  71.95 
 
 
418 aa  624  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  63.86 
 
 
446 aa  599  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3367  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/MsrB  43.4 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  54.74 
 
 
222 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  54.34 
 
 
219 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  52 
 
 
221 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  48.69 
 
 
229 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  50.27 
 
 
225 aa  186  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  51.37 
 
 
211 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  50.27 
 
 
211 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.366504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  48.9 
 
 
223 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  47.57 
 
 
220 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
213 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
212 aa  179  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
213 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  53.45 
 
 
228 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  49.21 
 
 
220 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  49.17 
 
 
220 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  52 
 
 
212 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  48.9 
 
 
216 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  49.21 
 
 
220 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  50.26 
 
 
215 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  52.3 
 
 
221 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  50.26 
 
 
215 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  47.62 
 
 
218 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  48.42 
 
 
222 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7872  methionine sulfoxide reductase A  49.73 
 
 
218 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  47.62 
 
 
217 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04598  methionine sulfoxide reductase A  51.15 
 
 
216 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  49.48 
 
 
218 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 
191 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  48.89 
 
 
215 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  47.62 
 
 
217 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  48.35 
 
 
222 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  47.09 
 
 
218 aa  173  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  44.97 
 
 
215 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  48.9 
 
 
240 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  48.9 
 
 
222 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
221 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  49.73 
 
 
213 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  46.7 
 
 
220 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  50.29 
 
 
218 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0432  peptide methionine sulfoxide reductase MSRA  50.87 
 
 
216 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1226  peptide methionine sulfoxide reductase  47.98 
 
 
224 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  50.29 
 
 
218 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  47.8 
 
 
222 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  46.35 
 
 
218 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0405  peptide methionine sulfoxide reductase  48.33 
 
 
215 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  47.31 
 
 
219 aa  169  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
220 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  46.11 
 
 
222 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1896  peptide methionine sulfoxide reductase  44.04 
 
 
223 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.486039  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
216 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  52.02 
 
 
212 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  45.13 
 
 
222 aa  167  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  46.67 
 
 
212 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  47.74 
 
 
224 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  47.74 
 
 
224 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 
217 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3417  methionine sulfoxide reductase A  46.03 
 
 
217 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3981  methionine sulfoxide reductase A  45.74 
 
 
219 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3605  peptide methionine sulfoxide reductase  51.12 
 
 
219 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  45.83 
 
 
220 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
219 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  54.6 
 
 
216 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3281  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 
219 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  49.13 
 
 
217 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  45.41 
 
 
212 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1031  methionine sulfoxide reductase A  49.12 
 
 
216 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.221296  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0908  methionine sulfoxide reductase A  49.12 
 
 
216 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
216 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08180  methionine-S-sulfoxide reductase  44.95 
 
 
222 aa  159  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0834233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  46.93 
 
 
213 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07230  methionine-S-sulfoxide reductase  42.93 
 
 
210 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2294  peptide methionine sulfoxide reductase  46.93 
 
 
208 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 
219 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09051  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 
242 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  45.25 
 
 
212 aa  156  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  45.25 
 
 
212 aa  156  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  45.25 
 
 
212 aa  156  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0844  peptide methionine sulfoxide reductase  44.57 
 
 
242 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0163  peptide methionine sulfoxide reductase  46.11 
 
 
238 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08400  methionine-S-sulfoxide reductase  41.46 
 
 
240 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  44.69 
 
 
213 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  44.13 
 
 
212 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 
221 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.532726 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  45.35 
 
 
219 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10381  peptide methionine sulfoxide reductase  44.75 
 
 
242 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.794772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  44.13 
 
 
212 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  43.39 
 
 
221 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09031  peptide methionine sulfoxide reductase  44.94 
 
 
242 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  43.6 
 
 
214 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0254  peptide methionine sulfoxide reductase  45.6 
 
 
249 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  46.29 
 
 
218 aa  150  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  47.93 
 
 
215 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4709  methionine sulfoxide reductase A  49.69 
 
 
218 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567677  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09231  peptide methionine sulfoxide reductase  45.6 
 
 
248 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0119188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1091  peptide methionine sulfoxide reductase  43.09 
 
 
223 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222581  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1311  methionine sulfoxide reductase A  42.05 
 
 
237 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.518036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>