16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4377 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4377  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0754365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4261  hypothetical protein  70.68 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215632  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4966  hypothetical protein  68.42 
 
 		 134 aa  185  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1526  hypothetical protein  53.33 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3667  putative thioredoxin  54 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3921  hypothetical protein  52.81 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.344581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4154  SoxS  45.26 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2810  hypothetical protein  42.15 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4147  SoxS  45.26 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2430  SoxS  38.79 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0622  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  35.63 
 
 		 446 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0783  peptide methionine sulfoxide reductase  31.58 
 
 		 444 aa  48.1  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0741  putative thioredoxin family protein  31.15 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3718  thioredoxin-related protein-like protein  27.27 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2272  peptide methionine sulfoxide reductase  30.36 
 
 		 418 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>