95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4099 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  100 
 
 		 127 aa  261  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  40 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  39.44 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  35.21 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  37.33 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  32.5 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  34.67 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  35.06 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  39.13 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  35.44 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  25.41 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  39.13 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  30.16 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  36.23 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  32.47 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  31.17 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  33.82 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  30.49 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  35.94 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  34.78 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.13 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  31.94 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  31.25 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  30 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  33.77 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  34.38 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  35 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  34.38 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  30.77 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  32.43 
 
 		 391 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  31.34 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  31.34 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  34.92 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.34 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  30.88 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  29.85 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.51 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  30.88 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  28.99 
 
 		 383 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  28.57 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  29.23 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  32.31 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  35.09 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  32.86 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1413  hypothetical protein  34.48 
 
 		 236 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  37.04 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  29.85 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  27.69 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  29.23 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  26.87 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  28.57 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  28 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  30.16 
 
 		 249 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  32.73 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  41.86 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  27.54 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  26.47 
 
 		 384 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  45.95 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  31.43 
 
 		 398 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  30.3 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  28.12 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  29.41 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  29.41 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  29.41 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  29.49 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  26.32 
 
 		 75 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 92 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1584  glutaredoxin  25.71 
 
 		 147 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0205634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  32.31 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  27.27 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1588  hypothetical protein  30.77 
 
 		 288 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302546  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  26.03 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  30.3 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  32.84 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  29.85 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  27.27 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  28.36 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  30.43 
 
 		 402 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  28.74 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  25.81 
 
 		 242 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  28.79 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  26.47 
 
 		 243 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>