49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0292 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  100 
 
 		 75 aa  157  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  81.33 
 
 		 75 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  83.56 
 
 		 76 aa  133  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  74.67 
 
 		 77 aa  130  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  71.23 
 
 		 76 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  50.68 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  46.58 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  37.5 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  30.14 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  27.27 
 
 		 383 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  38.33 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  34.38 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  29.58 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  29.73 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  24.68 
 
 		 391 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  23.38 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  38.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  23.38 
 
 		 384 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  24.68 
 
 		 402 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  26.03 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  28.21 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  23.61 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  23.61 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1038  glutaredoxin-like protein  25 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  40 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  31.51 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  32.84 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  27.03 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  32.84 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  26.87 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  31.34 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  25.35 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 125 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  30.99 
 
 		 106 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  23.61 
 
 		 84 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  22.97 
 
 		 84 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  29.17 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  29.85 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  36.76 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  32.35 
 
 		 398 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  29.85 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1167  glutaredoxin  25.68 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.957373  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1145  glutaredoxin  25.68 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.88 
 
 		 459 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>