33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02143 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  100 
 
 		 75 aa  157  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  95.89 
 
 		 76 aa  147  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  85.33 
 
 		 77 aa  140  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  81.33 
 
 		 75 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  71.62 
 
 		 76 aa  120  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  50.67 
 
 		 75 aa  94.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  47.95 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  37.5 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  30.67 
 
 		 383 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  37.33 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  37.33 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  30.26 
 
 		 391 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  36.67 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  34.38 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  27.4 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  33.77 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  29.27 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  25.33 
 
 		 402 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  29.85 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  31.51 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  27.03 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  25.33 
 
 		 384 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  35.38 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  24.68 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  34.85 
 
 		 398 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  24.66 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  28.17 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  31.88 
 
 		 442 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.78 
 
 		 459 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  22.22 
 
 		 80 aa  40  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  22.22 
 
 		 80 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>