More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0235 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 76 aa  157  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  56 
 
 		 81 aa  103  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  59.15 
 
 		 80 aa  101  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  54.79 
 
 		 194 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  54.93 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  54.93 
 
 		 84 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  45.95 
 
 		 80 aa  88.2  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  46.67 
 
 		 80 aa  87.4  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  49.32 
 
 		 175 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  45.33 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  52.11 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  47.3 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  47.95 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  47.95 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  49.3 
 
 		 383 aa  82  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  46.58 
 
 		 384 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  45.21 
 
 		 391 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  47.22 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  42.25 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  47.95 
 
 		 402 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  43.06 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  41.67 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  47.14 
 
 		 398 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  40.51 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  42.5 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  38.36 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  37.04 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  41.77 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  41.25 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  41.25 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  40.85 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  42.5 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  37.97 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  37.14 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  36.14 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  40.91 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  38.1 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  35.44 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  40 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  38.1 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  37.68 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  38.03 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  34.57 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  37.93 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  40.74 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  35.8 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  35.21 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  38.03 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  35 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  39.39 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  39.44 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  40.62 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  38.03 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  40.62 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  35.38 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  33.75 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  34.18 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  38.03 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  38.03 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  38.03 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  38.03 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  35.44 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  33.73 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  36.59 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  31.33 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  39.02 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  36.25 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  37.8 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  37.5 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  36.25 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  35.44 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>