128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3551 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  100 
 
 		 106 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  46.79 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  46.88 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  50.72 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  51.47 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  36.84 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  44.29 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  35.21 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  39.39 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  32.81 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  32.81 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  40 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  40.3 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  33.8 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  35.38 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  43.94 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1584  glutaredoxin  33.82 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0205634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  36.92 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  32.39 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  41.38 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.33 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  35.71 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.29 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  42.59 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  29.49 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  33.82 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  33.85 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  26.76 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  33.85 
 
 		 80 aa  50.1  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2587  glutaredoxin  30.99 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  29.17 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  29.17 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  29.17 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37.5 
 
 		 384 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  39.13 
 
 		 255 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  34.29 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  32.26 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  31.17 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  40 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  36.92 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  37.88 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  32.88 
 
 		 391 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  28.17 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  28.17 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  43.14 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  30.14 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  29.17 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  32.61 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  39.66 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  42.22 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  40.74 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  39.29 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.77 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  28.17 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  28.17 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  35.19 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  32.2 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  28.77 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  29.09 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  33.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1969  hypothetical protein  38.46 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  27.14 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  34.43 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  31.25 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  29.82 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  26.39 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  28.95 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  31.03 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  31.88 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  24.29 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  28.36 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  30.77 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  40 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  30.99 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  40.24 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  27.14 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  35.38 
 
 		 88 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>