More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0505 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  100 
 
 
175 aa  353  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  55.84 
 
 
80 aa  99  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  58.67 
 
 
84 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  57.53 
 
 
84 aa  94.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  51.95 
 
 
80 aa  91.3  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  52.78 
 
 
81 aa  88.6  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  52.11 
 
 
391 aa  87  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  49.32 
 
 
76 aa  86.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  49.32 
 
 
80 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  49.32 
 
 
80 aa  85.1  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  52.78 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  41.46 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  48.05 
 
 
80 aa  82  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  48.68 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  49.35 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  42.31 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  44 
 
 
80 aa  78.2  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  42.47 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  38.94 
 
 
511 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  42.11 
 
 
260 aa  72  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  41.43 
 
 
383 aa  70.9  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  38.27 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  39.47 
 
 
123 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  36.71 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  42.7 
 
 
398 aa  68.6  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  39.73 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  40.28 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  40.3 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  39.73 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  45.65 
 
 
460 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  38.16 
 
 
76 aa  63.2  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  32.5 
 
 
127 aa  62.4  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  30.12 
 
 
485 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  30.12 
 
 
502 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  30.12 
 
 
502 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  30.12 
 
 
502 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  30.12 
 
 
502 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  30.12 
 
 
502 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  30.12 
 
 
461 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  28.74 
 
 
499 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  28.74 
 
 
499 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  35.59 
 
 
423 aa  61.6  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  35.53 
 
 
122 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  35.53 
 
 
121 aa  60.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  41.11 
 
 
496 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  47.06 
 
 
95 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  35.63 
 
 
87 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  28.74 
 
 
498 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  28.74 
 
 
498 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  28.74 
 
 
498 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  33.6 
 
 
476 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  34.18 
 
 
134 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  29.52 
 
 
485 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  30.72 
 
 
503 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  35.16 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  30.12 
 
 
503 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  42.65 
 
 
85 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  42.65 
 
 
85 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  29.34 
 
 
507 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  32.95 
 
 
133 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  38.67 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  28.66 
 
 
453 aa  58.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  44.78 
 
 
116 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  31.76 
 
 
478 aa  57.8  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  31.09 
 
 
453 aa  57.8  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  38.89 
 
 
496 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  38.89 
 
 
496 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  28.14 
 
 
500 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.81 
 
 
417 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  29.17 
 
 
490 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  29.52 
 
 
505 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  36.67 
 
 
450 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  33.75 
 
 
113 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  40 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  37.78 
 
 
450 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  37.78 
 
 
450 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  37.78 
 
 
450 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  28.03 
 
 
451 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  36.84 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  37.5 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  31.18 
 
 
528 aa  55.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  28.74 
 
 
505 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  28.66 
 
 
469 aa  55.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  37.78 
 
 
503 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  37.78 
 
 
501 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  41.18 
 
 
85 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  37.78 
 
 
503 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  27.71 
 
 
502 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  31.93 
 
 
459 aa  54.7  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  30.25 
 
 
453 aa  54.7  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  27.33 
 
 
467 aa  55.1  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  30.54 
 
 
498 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2300  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  26.38 
 
 
493 aa  54.7  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  28.57 
 
 
452 aa  54.3  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  28.03 
 
 
450 aa  54.3  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  37.8 
 
 
525 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  30.38 
 
 
480 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  37.93 
 
 
59 aa  54.3  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  31.08 
 
 
77 aa  54.3  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  31.08 
 
 
77 aa  54.3  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>