More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1427 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  100 
 
 
80 aa  170  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  63.75 
 
 
80 aa  122  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  62.5 
 
 
80 aa  120  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  63.75 
 
 
80 aa  119  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  61.25 
 
 
80 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  58.97 
 
 
81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  56.76 
 
 
80 aa  98.6  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  52 
 
 
84 aa  92  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  52.7 
 
 
81 aa  92  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  50.67 
 
 
194 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  52 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
76 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  48.05 
 
 
175 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  45.21 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  45.21 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  42.67 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  47.95 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  45.83 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  36.99 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  41.1 
 
 
402 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  43.84 
 
 
391 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  43.24 
 
 
76 aa  71.6  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  37.5 
 
 
260 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  32.88 
 
 
383 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  37.8 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  40 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  40 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  38.75 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  37.97 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  36.47 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  35.37 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  37.5 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  36.92 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  35.8 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  35.8 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  32.05 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  32.05 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  34.85 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  32.05 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  38.81 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  35 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  35.8 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  40.3 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  35.8 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  42.03 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  35.21 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  32.53 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  38.36 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 
78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  35.94 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  31.71 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  36.05 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  35.71 
 
 
398 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  36.05 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  36 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  36.92 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  32.1 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  35 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  32.1 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  32.53 
 
 
87 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  32.5 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0707  glutaredoxin  30.38 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  41.54 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  31.82 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  31.82 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  31.25 
 
 
85 aa  50.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  36.92 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
85 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  30.3 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.94 
 
 
459 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  31.25 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  36.92 
 
 
85 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>