284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1508 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  52.7 
 
 
80 aa  76.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  42.67 
 
 
80 aa  73.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 
80 aa  71.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  43.24 
 
 
81 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  42.25 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
75 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  49.25 
 
 
84 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  42.11 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  47.76 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  45.95 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  45.21 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  44.59 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  45.21 
 
 
194 aa  63.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  39.47 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  38.16 
 
 
175 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  39.19 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  47.06 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  36.99 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.98 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  38.36 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  35.21 
 
 
384 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  42.65 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  42.65 
 
 
85 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  39.13 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  39.71 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  39.71 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  39.71 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  43.28 
 
 
82 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  39.13 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.71 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  39.71 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  39.71 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  40 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  31.51 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  40 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  40 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  40.3 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  30.56 
 
 
383 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  36.84 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  38.24 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  41.79 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  41.79 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  41.79 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  41.79 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  41.79 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  33.8 
 
 
106 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  40.3 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  32.39 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  31.88 
 
 
70 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  40.58 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  40.58 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  39.71 
 
 
84 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  36.36 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  41.18 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 
81 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  35.82 
 
 
81 aa  52  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  35.82 
 
 
81 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  39.13 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 
81 aa  52  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 
81 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  33.33 
 
 
260 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 
81 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  36.84 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.8 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  35.29 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  33.9 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  34.21 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 
81 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  40.3 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  40.3 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  35.21 
 
 
402 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 
81 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  39.71 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  37.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  39.71 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  28.17 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  35.29 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  35.29 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  31.94 
 
 
168 aa  50.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  32.43 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  32.35 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  36.59 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  28.77 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  40.91 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.35 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.43 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>