More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0169 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  100 
 
 
402 aa  814    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  54.83 
 
 
384 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  54.74 
 
 
383 aa  433  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  52.11 
 
 
391 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  40.41 
 
 
395 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  40 
 
 
398 aa  256  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  43.32 
 
 
304 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  41.78 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  41.25 
 
 
312 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  43.1 
 
 
340 aa  223  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.07 
 
 
314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  39.61 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  43.85 
 
 
304 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0428  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  40.85 
 
 
507 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.273089  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  38.64 
 
 
320 aa  219  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0439  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  40.85 
 
 
507 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00965821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  37.75 
 
 
529 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  36.04 
 
 
442 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  37.97 
 
 
308 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  39.22 
 
 
306 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.42 
 
 
326 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0649931  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0845  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.94 
 
 
312 aa  218  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  34.63 
 
 
510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  39.38 
 
 
318 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  39.22 
 
 
306 aa  216  7e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  37.22 
 
 
523 aa  216  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  41.69 
 
 
343 aa  215  9e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  39.22 
 
 
306 aa  215  9e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  40.07 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  38.59 
 
 
321 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.87 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40 
 
 
331 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  41.48 
 
 
333 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  41.48 
 
 
333 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  41.48 
 
 
333 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  39.94 
 
 
318 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  41.75 
 
 
313 aa  212  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  42.48 
 
 
359 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
509 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  41.77 
 
 
326 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2074  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.41 
 
 
525 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.113135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  40.67 
 
 
306 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0666  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  38.62 
 
 
535 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  38.12 
 
 
318 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0047  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.44 
 
 
512 aa  209  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0756  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.62 
 
 
535 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.13 
 
 
526 aa  209  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0449918  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  40.45 
 
 
333 aa  209  7e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  38.12 
 
 
318 aa  209  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2044  alkyl hydroperoxide reductase subunit  38.62 
 
 
622 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  37.81 
 
 
318 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  38.12 
 
 
318 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  38.12 
 
 
321 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  38.12 
 
 
321 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  38.12 
 
 
321 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  38.12 
 
 
318 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  38.12 
 
 
318 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.99 
 
 
560 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  38.12 
 
 
318 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
336 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  41.81 
 
 
311 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0059  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.38 
 
 
507 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.492285  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1795  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  35.66 
 
 
525 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114206  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.64 
 
 
533 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.64 
 
 
533 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1814  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  42.47 
 
 
523 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  41.64 
 
 
533 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  40.85 
 
 
353 aa  206  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  42.57 
 
 
330 aa  206  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0619  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.94 
 
 
515 aa  206  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.633675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.42 
 
 
521 aa  206  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  42.21 
 
 
309 aa  206  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  38.78 
 
 
313 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  39.5 
 
 
361 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  38.11 
 
 
315 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.98 
 
 
532 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  39.09 
 
 
318 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  41.83 
 
 
532 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.58 
 
 
532 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  38.17 
 
 
330 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  38.44 
 
 
318 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.98 
 
 
532 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.85 
 
 
529 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.054716 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  35.58 
 
 
569 aa  204  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  37.22 
 
 
317 aa  203  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001043  alkyl hydroperoxide reductase protein F  39.48 
 
 
522 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30284  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  37.33 
 
 
323 aa  202  6e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
310 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.85 
 
 
525 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1091  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.9 
 
 
535 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0782  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  37.66 
 
 
531 aa  202  9e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0983751  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  38.49 
 
 
334 aa  202  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04761  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  39.16 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  39.61 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1196  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.27 
 
 
518 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000420739  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0870  subunit F of alkyl hydroperoxide reductase  37.66 
 
 
531 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.037495  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  38.11 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  37.85 
 
 
601 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  38.91 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  40.66 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>