More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1512 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  54.28 
 
 		 304 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  54.13 
 
 		 311 aa  342  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  53.14 
 
 		 304 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  54.46 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  47.39 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  46.73 
 
 		 306 aa  299  3e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  47.35 
 
 		 323 aa  299  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 306 aa  295  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  48.18 
 
 		 306 aa  295  5e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  50 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  44.84 
 
 		 315 aa  291  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  47.16 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  45.54 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  46.73 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  48.67 
 
 		 304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  46.3 
 
 		 311 aa  286  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  46.3 
 
 		 311 aa  286  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  44.63 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  46.41 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  46.38 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  48.86 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  44.66 
 
 		 318 aa  285  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  50.64 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  49.34 
 
 		 312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  44.01 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  43.04 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  49.19 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  46.84 
 
 		 317 aa  278  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 318 aa  278  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  42.81 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  42.81 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  42.81 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  43.04 
 
 		 318 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 318 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  43.04 
 
 		 318 aa  278  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  46.51 
 
 		 317 aa  278  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  43.04 
 
 		 318 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  51.49 
 
 		 307 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  47.18 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  47.19 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  44.81 
 
 		 409 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  43.61 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.67 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  47.37 
 
 		 311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  45.6 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.26 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  45.05 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  44.52 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  47.51 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  46.56 
 
 		 331 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  49.3 
 
 		 306 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  46.52 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  45.57 
 
 		 336 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  45.31 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  44.34 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  46.6 
 
 		 314 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  43.79 
 
 		 333 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  48.4 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  46.82 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  46.15 
 
 		 396 aa  263  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  46.82 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.16 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  44.7 
 
 		 302 aa  262  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  43.32 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  44.22 
 
 		 316 aa  262  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  46.18 
 
 		 310 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 333 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 333 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 333 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  47.92 
 
 		 304 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  41.97 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  46.34 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  44.3 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  46.86 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  44.7 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  44.12 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  43.46 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  43.59 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  43.59 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  43.59 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  43.56 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  43.59 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  44.23 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  43.59 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  45.39 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.7 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  44.09 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  43.93 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  43.09 
 
 		 312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  42.12 
 
 		 332 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  41.99 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>