More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1576 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  98.43 
 
 		 321 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  100 
 
 		 327 aa  670    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  74.04 
 
 		 312 aa  461  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  73.98 
 
 		 326 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  53.25 
 
 		 304 aa  337  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  52.77 
 
 		 323 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  52.22 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  51.14 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  53.57 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  54.19 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  53.57 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  48.74 
 
 		 348 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.25 
 
 		 321 aa  305  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  50.96 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  50.97 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  49.52 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  51.43 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  48.11 
 
 		 318 aa  298  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  54.52 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  46.65 
 
 		 321 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  46.65 
 
 		 321 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  46.65 
 
 		 321 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  49.1 
 
 		 332 aa  295  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  47.17 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  47.17 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  47.17 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  49.36 
 
 		 331 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  47.17 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 312 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  46.86 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 409 aa  293  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  48.86 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  47.57 
 
 		 304 aa  292  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  49.21 
 
 		 321 aa  292  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 309 aa  292  6e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 335 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  51.54 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  51.26 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  52.75 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  46.54 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  52.79 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  46.54 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  51.75 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  49.02 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  48.39 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  49.35 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  50.81 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  49.06 
 
 		 345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 314 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  52.2 
 
 		 321 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.05 
 
 		 407 aa  288  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  48.03 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  48.85 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  49.03 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  48.09 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  48.9 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  48.71 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  45 
 
 		 316 aa  285  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  48.52 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  49.51 
 
 		 309 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  48.2 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  49.35 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  44.69 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  47.48 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  48.92 
 
 		 324 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  49.69 
 
 		 320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  46.95 
 
 		 330 aa  282  7.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  48.69 
 
 		 313 aa  281  8.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  46.37 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  47.91 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  49.03 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  48.1 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  45.75 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  46.58 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  46.77 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  46.58 
 
 		 322 aa  279  6e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  45.63 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  47.44 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  45.02 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  48.24 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  48.39 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  48.88 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  45.6 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  47.96 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  47.96 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  47.96 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  48.39 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  47.39 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  46.77 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  44.81 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  46.77 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  49.04 
 
 		 313 aa  275  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  46.2 
 
 		 332 aa  275  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  45.25 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  45.25 
 
 		 306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>