More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0567 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  100 
 
 		 340 aa  687    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  53.4 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  53.09 
 
 		 317 aa  346  4e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  48.88 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  51.78 
 
 		 323 aa  302  5.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  50.96 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  50.16 
 
 		 315 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  46.65 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  49.51 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  48.55 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  48.41 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  48.09 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  48.09 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  48.09 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  48.09 
 
 		 318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  48.09 
 
 		 318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  48.09 
 
 		 318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  48.09 
 
 		 318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  48.09 
 
 		 318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  49.34 
 
 		 306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  48.09 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  45.83 
 
 		 396 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  44.55 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  48.03 
 
 		 309 aa  278  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  46.69 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  44.34 
 
 		 409 aa  272  6e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  44.65 
 
 		 304 aa  271  9e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  45.05 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  47.42 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  46.77 
 
 		 316 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  45.31 
 
 		 311 aa  268  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  45.31 
 
 		 311 aa  268  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  45.42 
 
 		 306 aa  268  8e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  45.42 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  44.69 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  48.14 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  44.05 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  44.37 
 
 		 308 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  47 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  44.66 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  43.44 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  43.09 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  44.77 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  43.89 
 
 		 317 aa  262  6e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  42.95 
 
 		 308 aa  262  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  46.39 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  47.73 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  43.62 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  45.1 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.83 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  42.17 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  40.63 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  41.96 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  45.22 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  42.36 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  45.22 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  40.57 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  48.75 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  41.5 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  43.99 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.57 
 
 		 556 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  43.12 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.96 
 
 		 407 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  43.71 
 
 		 326 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  41.3 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  42.44 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.31 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  40.13 
 
 		 311 aa  242  7.999999999999999e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  42.86 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  42.86 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  41.38 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  41.21 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.51 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  40.85 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  45.65 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  37.08 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42 
 
 		 551 aa  235  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  42.68 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.46 
 
 		 579 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  40.14 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  40.89 
 
 		 555 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  39.56 
 
 		 547 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  42.95 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  42.12 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  39.93 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  40.65 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  40.72 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.06 
 
 		 547 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  43.91 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  40.82 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  41.69 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  39.8 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  39.68 
 
 		 318 aa  225  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>