More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_483 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  97.71 
 
 		 306 aa  608  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  89.84 
 
 		 306 aa  565  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  47.51 
 
 		 304 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  46.73 
 
 		 309 aa  299  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  45.67 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  43.14 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  45.15 
 
 		 323 aa  288  9e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  47.68 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  45.87 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  45.64 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  45.85 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  46 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  43.46 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  44.37 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  45.42 
 
 		 340 aa  268  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  43.19 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  44.82 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  45.15 
 
 		 326 aa  262  6e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  45.25 
 
 		 327 aa  262  6.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  45.25 
 
 		 321 aa  261  8.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  42.9 
 
 		 315 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  41.81 
 
 		 334 aa  257  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  42.33 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  42.33 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  45.16 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  44.33 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  43.67 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  41.91 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  42.57 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  41.58 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  44.12 
 
 		 308 aa  248  8e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  43.18 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  42.28 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  42.52 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  43.67 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.14 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  42.35 
 
 		 310 aa  245  6e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  38.44 
 
 		 311 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  42.57 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  42.36 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  39.54 
 
 		 409 aa  243  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  41.33 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  40.59 
 
 		 346 aa  242  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.67 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  41.2 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.26 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.26 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  40.26 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  40.26 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  40.85 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  39.6 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  39.14 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.82 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  40.58 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  39.6 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  39.53 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 317 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  39.27 
 
 		 335 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  41.2 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  40 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  40.85 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  40.06 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 334 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  40.85 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  40.85 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  42.02 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  42.02 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  42.02 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  42.02 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  40.67 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40.46 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  40.79 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  39.33 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  40.07 
 
 		 332 aa  235  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  38.36 
 
 		 330 aa  234  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  42.57 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  40.58 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  38.33 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  38.46 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  41.04 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  38.46 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  39.34 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  40.63 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  40.72 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  41.33 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  40.78 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>