More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3408 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  100 
 
 		 320 aa  651    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  46.6 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  46.13 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  47.68 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  44.44 
 
 		 318 aa  285  8e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  44.77 
 
 		 321 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  44.77 
 
 		 321 aa  285  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  44.77 
 
 		 321 aa  285  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  44.77 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  44.77 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  44.77 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  44.77 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  44.12 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  45.4 
 
 		 318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  45.57 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  43.79 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  44.48 
 
 		 396 aa  278  8e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  43.61 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  45.48 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  44.84 
 
 		 317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  44.34 
 
 		 320 aa  271  8.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  44.98 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  45.31 
 
 		 311 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  45.31 
 
 		 311 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  43.42 
 
 		 310 aa  266  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  43.56 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  43.75 
 
 		 310 aa  266  5e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  45.25 
 
 		 306 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  43.38 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  45.36 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  43.85 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  46.05 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  45.28 
 
 		 324 aa  262  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  41.56 
 
 		 409 aa  262  6.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  43.61 
 
 		 308 aa  261  8e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  41.5 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  43.97 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  43.75 
 
 		 323 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  43.63 
 
 		 312 aa  258  8e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  45.83 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 326 aa  256  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  42.07 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1869  thioredoxin reductase  45.31 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0723907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  41.75 
 
 		 311 aa  255  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  42.95 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.56 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  43.51 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  41.86 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  42.67 
 
 		 311 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  45.78 
 
 		 308 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  46.69 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  45.51 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  46.03 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  44.87 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  47.18 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  47.1 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  46.2 
 
 		 306 aa  249  6e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  42.81 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  43.18 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  45.03 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  43.18 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  42.86 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 316 aa  245  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0182  thioredoxin-disulfide reductase  42.99 
 
 		 312 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.68776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0172  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454317  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  41.67 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  43.59 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  41.1 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  41.61 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0142  thioredoxin-disulfide reductase  42.68 
 
 		 312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  42.36 
 
 		 312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  41.42 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  41.19 
 
 		 361 aa  242  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  40.59 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  39.74 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  40 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  44.77 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  42.21 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  41.25 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  41.43 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  45.13 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  43.4 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  39.22 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  41.04 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  41.04 
 
 		 317 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  40.85 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  42.41 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.84 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  47.02 
 
 		 306 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 346 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  44.63 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  41.35 
 
 		 345 aa  235  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>