More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1082 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  100 
 
 
310 aa  630  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  45.1 
 
 
304 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  47.23 
 
 
313 aa  264  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  46.73 
 
 
304 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  42.81 
 
 
306 aa  258  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  44.3 
 
 
311 aa  255  7e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  44.48 
 
 
312 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  42.36 
 
 
340 aa  248  7e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  42.67 
 
 
306 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  42.72 
 
 
308 aa  245  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  42.35 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  46.2 
 
 
308 aa  244  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  42.48 
 
 
311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  43.14 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  43.65 
 
 
311 aa  242  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  43.65 
 
 
312 aa  242  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  41.91 
 
 
320 aa  241  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  38.44 
 
 
330 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  43.46 
 
 
306 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  40.33 
 
 
309 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  42.53 
 
 
304 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  38.83 
 
 
310 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  41.83 
 
 
311 aa  237  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  41.31 
 
 
311 aa  236  3e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  43.18 
 
 
315 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  40.07 
 
 
316 aa  235  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  39.54 
 
 
331 aa  235  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  40.58 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  42.02 
 
 
308 aa  232  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.53 
 
 
326 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  43.18 
 
 
318 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
318 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  41.83 
 
 
324 aa  230  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  37.91 
 
 
335 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  40.72 
 
 
311 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  42.11 
 
 
321 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
348 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  39.29 
 
 
310 aa  229  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  38.26 
 
 
333 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  38.26 
 
 
333 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  38.26 
 
 
333 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  42.11 
 
 
321 aa  228  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  40.07 
 
 
313 aa  228  9e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  43.69 
 
 
321 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  39.22 
 
 
346 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  40.65 
 
 
311 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  40.72 
 
 
323 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  45.48 
 
 
308 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  38.71 
 
 
310 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  41.97 
 
 
321 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  44.77 
 
 
320 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  43.37 
 
 
327 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  39.74 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  40.78 
 
 
396 aa  225  6e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  40.07 
 
 
309 aa  225  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
314 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
314 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  42.95 
 
 
308 aa  225  9e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  41.94 
 
 
309 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  41.88 
 
 
318 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  42.58 
 
 
320 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  42.58 
 
 
320 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  41.56 
 
 
318 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  41.56 
 
 
321 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  41.56 
 
 
321 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  41.56 
 
 
321 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  41.56 
 
 
318 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  41.56 
 
 
318 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  42.58 
 
 
320 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  39.02 
 
 
332 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  42.58 
 
 
320 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  41.56 
 
 
318 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  39.41 
 
 
353 aa  223  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  41.69 
 
 
309 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  42.02 
 
 
311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  41.88 
 
 
318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  37.54 
 
 
334 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  37.34 
 
 
333 aa  222  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  41.88 
 
 
318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  38.24 
 
 
310 aa  222  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  40 
 
 
317 aa  222  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  38.56 
 
 
340 aa  222  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
334 aa  221  8e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  42.76 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  41.58 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  38.24 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  38.69 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  41.86 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  40.52 
 
 
311 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  41.18 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  39.47 
 
 
326 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  39.55 
 
 
337 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  43.31 
 
 
307 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  37.58 
 
 
319 aa  218  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  39.56 
 
 
318 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  40.58 
 
 
318 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
313 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  39.74 
 
 
310 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  38.11 
 
 
330 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>