More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0559 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  100 
 
 
304 aa  610  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  54.7 
 
 
306 aa  333  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  50.66 
 
 
308 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  48.68 
 
 
309 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  48.5 
 
 
304 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  46.71 
 
 
304 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  47.37 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  45.48 
 
 
309 aa  275  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  50.88 
 
 
306 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  48.68 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.83 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  45.36 
 
 
312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  42.52 
 
 
311 aa  268  8.999999999999999e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  43.67 
 
 
308 aa  263  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  45.64 
 
 
317 aa  259  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  45.64 
 
 
317 aa  259  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  42 
 
 
306 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  45.7 
 
 
304 aa  256  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  45.93 
 
 
306 aa  255  6e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  48.01 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  45.72 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  44.12 
 
 
311 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  42.14 
 
 
334 aa  252  6e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  43.89 
 
 
315 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  41 
 
 
306 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  40.67 
 
 
306 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  44.04 
 
 
317 aa  250  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  44.22 
 
 
318 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  43.46 
 
 
330 aa  249  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  42.57 
 
 
311 aa  249  5e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.33 
 
 
427 aa  249  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  43.05 
 
 
308 aa  247  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  44.63 
 
 
309 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  43.19 
 
 
336 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  41.72 
 
 
318 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  43.71 
 
 
409 aa  245  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  42.57 
 
 
340 aa  243  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  42.72 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  43.19 
 
 
331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  43.14 
 
 
334 aa  242  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  40.53 
 
 
318 aa  242  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  42.76 
 
 
316 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  42.76 
 
 
333 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.2 
 
 
407 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  42.76 
 
 
333 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  42.76 
 
 
333 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  41.06 
 
 
318 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  45.33 
 
 
396 aa  240  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  40.73 
 
 
318 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  40.73 
 
 
321 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.73 
 
 
321 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  39.8 
 
 
311 aa  240  2e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.73 
 
 
321 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  40.73 
 
 
318 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  40.73 
 
 
318 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  40.73 
 
 
318 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  40.92 
 
 
311 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  40.92 
 
 
311 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  42.86 
 
 
324 aa  240  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  41.06 
 
 
318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  42.38 
 
 
302 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  43.14 
 
 
311 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  40.4 
 
 
318 aa  238  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  41.2 
 
 
330 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  40.07 
 
 
310 aa  238  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  41.06 
 
 
335 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  42.43 
 
 
332 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  41.99 
 
 
308 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.33 
 
 
326 aa  236  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  39.47 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  41.18 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  41.78 
 
 
333 aa  235  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  44.74 
 
 
313 aa  235  8e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  40.92 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  41.18 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.33 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  42.81 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  41.33 
 
 
312 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  41.2 
 
 
307 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  39.67 
 
 
313 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  43.05 
 
 
327 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  38.44 
 
 
309 aa  229  4e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  39.09 
 
 
323 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  37.94 
 
 
312 aa  229  6e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  38.61 
 
 
316 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
311 aa  228  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  39.87 
 
 
330 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
318 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  40.67 
 
 
310 aa  227  2e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  40.39 
 
 
333 aa  226  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  42.07 
 
 
306 aa  226  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  39.93 
 
 
310 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  43.43 
 
 
316 aa  226  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  42.16 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  39.94 
 
 
359 aa  225  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  40 
 
 
346 aa  224  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  40.91 
 
 
310 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  38.03 
 
 
310 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  38.24 
 
 
320 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
318 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>