More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1853 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
305 aa  603  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  50.83 
 
 
306 aa  299  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  46.71 
 
 
323 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  46.56 
 
 
304 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  48.47 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  44.7 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  47.28 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  46.6 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  50.75 
 
 
306 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  47.28 
 
 
320 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  43.82 
 
 
308 aa  263  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  46.25 
 
 
316 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  47.16 
 
 
309 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  47.46 
 
 
333 aa  260  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  47.83 
 
 
304 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  43 
 
 
312 aa  259  3e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  46.15 
 
 
319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  45.57 
 
 
396 aa  259  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  47.62 
 
 
310 aa  258  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  41.83 
 
 
340 aa  256  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  46.94 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  46.6 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  46 
 
 
332 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  45.92 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  46.94 
 
 
320 aa  251  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  46.03 
 
 
310 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  42.28 
 
 
309 aa  251  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  48.47 
 
 
307 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  45.21 
 
 
334 aa  248  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  45.25 
 
 
326 aa  248  8e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  41.64 
 
 
306 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  42.27 
 
 
334 aa  246  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  40.14 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  40.14 
 
 
306 aa  245  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  45.42 
 
 
309 aa  244  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  42.42 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  44.44 
 
 
304 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  44.63 
 
 
346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  43.24 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  47.46 
 
 
318 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  41.55 
 
 
318 aa  242  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  44.26 
 
 
318 aa  242  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  41.41 
 
 
318 aa  242  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  43.56 
 
 
320 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  41.55 
 
 
318 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  40.88 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  40.88 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.88 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.88 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  40.88 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  40.88 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  40.88 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  43.14 
 
 
318 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  43.48 
 
 
359 aa  239  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  40.73 
 
 
308 aa  239  5e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  44.97 
 
 
333 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  44.55 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  41.56 
 
 
409 aa  238  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  45.85 
 
 
325 aa  238  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  41.55 
 
 
315 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  44.37 
 
 
327 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  39.2 
 
 
318 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  45.52 
 
 
302 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  40.2 
 
 
310 aa  236  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  40.86 
 
 
311 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  40.86 
 
 
311 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  42 
 
 
321 aa  235  6e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  44.22 
 
 
348 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  40.96 
 
 
310 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  43.73 
 
 
330 aa  235  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  41.28 
 
 
311 aa  235  9e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  43.1 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  42.32 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  40.66 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  45.3 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  38.54 
 
 
323 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  41 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  42.09 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  44.3 
 
 
332 aa  231  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.66 
 
 
427 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.47 
 
 
407 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  44.33 
 
 
330 aa  229  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  43.16 
 
 
329 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  42.23 
 
 
314 aa  229  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  42.86 
 
 
311 aa  229  6e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  43.99 
 
 
317 aa  229  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  39.46 
 
 
310 aa  228  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  44.68 
 
 
317 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  43.64 
 
 
362 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
317 aa  228  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  39.93 
 
 
312 aa  227  2e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  44.01 
 
 
327 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  42.19 
 
 
311 aa  225  6e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  42.86 
 
 
353 aa  225  7e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  38.87 
 
 
460 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  43.89 
 
 
307 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  42.23 
 
 
335 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  41.02 
 
 
316 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  44.67 
 
 
348 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  43.3 
 
 
331 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>