More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0855 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  100 
 
 		 316 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  73.8 
 
 		 316 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  65.62 
 
 		 317 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  65.93 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  46.65 
 
 		 340 aa  291  9e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  51.52 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  51.85 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  47.45 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  50.34 
 
 		 318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  48.65 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  48.65 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  48.65 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  48.65 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  48.65 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  48.65 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  48.65 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  47.3 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  47.97 
 
 		 318 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  47.3 
 
 		 318 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  48.16 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  48.16 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  48.66 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.77 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  44.52 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  43.38 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  45.89 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  43.62 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  47.47 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  43.96 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  44.75 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  43.19 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  44.44 
 
 		 317 aa  252  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  42.62 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  43.77 
 
 		 396 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.04 
 
 		 555 aa  249  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  45.48 
 
 		 316 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  43.87 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  44.52 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  41.67 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  44.86 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  47.14 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  40.34 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.28 
 
 		 427 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  42.52 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.63 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  44.41 
 
 		 638 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  44.22 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  44.22 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  42 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  43.37 
 
 		 555 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  43.65 
 
 		 556 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.29 
 
 		 407 aa  235  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  40.6 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  41.61 
 
 		 313 aa  235  9e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  43.75 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  42.28 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  42.18 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  44.3 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 332 aa  229  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  42.18 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 304 aa  229  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  41.16 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.83 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  45.79 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 319 aa  225  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  42.66 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  41.84 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.02 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  41.61 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  39.39 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  39.93 
 
 		 569 aa  222  6e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  40.54 
 
 		 334 aa  222  8e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  40.86 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  40.94 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  39.34 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  40.46 
 
 		 319 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  43.14 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  39.34 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  39.13 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  40.53 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  38.41 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  39.93 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  39.25 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.82 
 
 		 509 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  37.79 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  40.53 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  38.75 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  41.97 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  41.53 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  39.13 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  39.93 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  38.94 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  41.3 
 
 		 331 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  39.46 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>