More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2697 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  62.64 
 
 
550 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
579 aa  1179    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.18 
 
 
602 aa  774    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.53 
 
 
551 aa  587  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.1 
 
 
547 aa  545  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.13 
 
 
548 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.7 
 
 
316 aa  265  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  43.79 
 
 
323 aa  251  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  45.24 
 
 
304 aa  249  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  47.18 
 
 
321 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  47.18 
 
 
327 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  42.3 
 
 
315 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  45.51 
 
 
326 aa  237  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  42.72 
 
 
318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  40.46 
 
 
340 aa  234  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  46.78 
 
 
312 aa  234  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  49.18 
 
 
345 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  44.75 
 
 
304 aa  234  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  43.31 
 
 
308 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  43.52 
 
 
312 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  43.52 
 
 
312 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  45.82 
 
 
321 aa  229  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  40.34 
 
 
318 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  40.34 
 
 
321 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.34 
 
 
321 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.34 
 
 
321 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  40.34 
 
 
318 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  41.02 
 
 
318 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  40.34 
 
 
318 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  40.34 
 
 
318 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  42.23 
 
 
310 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  46.15 
 
 
321 aa  228  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  40 
 
 
318 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  46.3 
 
 
321 aa  227  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  45.82 
 
 
321 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  41.53 
 
 
320 aa  226  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  40.68 
 
 
318 aa  226  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  42.86 
 
 
331 aa  226  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  43.97 
 
 
324 aa  226  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  42.44 
 
 
317 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  44.55 
 
 
334 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  43.93 
 
 
317 aa  226  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  43.65 
 
 
317 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  43.75 
 
 
335 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  43.13 
 
 
317 aa  225  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  40.92 
 
 
317 aa  224  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  43.75 
 
 
312 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  41.22 
 
 
396 aa  224  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  40.48 
 
 
318 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  45.1 
 
 
361 aa  223  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  43.43 
 
 
310 aa  223  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
308 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  45.07 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  43.87 
 
 
323 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  43.87 
 
 
323 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  41.75 
 
 
330 aa  220  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  43.66 
 
 
306 aa  220  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  42.3 
 
 
343 aa  219  7.999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  42.24 
 
 
320 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  45.82 
 
 
321 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  45.54 
 
 
321 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  40 
 
 
306 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  42.24 
 
 
320 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  42.62 
 
 
330 aa  219  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
310 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
427 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  42.76 
 
 
348 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  42.95 
 
 
340 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  43.37 
 
 
320 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  41.1 
 
 
314 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  41.9 
 
 
317 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  43.62 
 
 
333 aa  217  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  45.7 
 
 
321 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  46.49 
 
 
321 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  41.67 
 
 
311 aa  217  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  43.37 
 
 
320 aa  217  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  40.57 
 
 
317 aa  217  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  41.47 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  41.14 
 
 
316 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  43.24 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  39.86 
 
 
318 aa  216  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  41.29 
 
 
317 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  41.29 
 
 
320 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  43.73 
 
 
322 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  31.39 
 
 
510 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  41.5 
 
 
316 aa  215  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  41.41 
 
 
310 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  43.11 
 
 
317 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  42.95 
 
 
332 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.39 
 
 
523 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  42.95 
 
 
331 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  38.24 
 
 
310 aa  214  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  41.97 
 
 
333 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  41.97 
 
 
333 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  41.97 
 
 
333 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  41.45 
 
 
313 aa  213  7e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  38.98 
 
 
306 aa  213  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
304 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  41.35 
 
 
335 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  40.85 
 
 
316 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>