More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1200 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  100 
 
 		 308 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  62.99 
 
 		 307 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  62.99 
 
 		 307 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2066  thioredoxin reductase (NADPH)  60.07 
 
 		 292 aa  359  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  51.13 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  45.03 
 
 		 306 aa  278  8e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  45.54 
 
 		 304 aa  272  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  46.62 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  44.48 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  43.42 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  40.52 
 
 		 318 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  42.48 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  42.05 
 
 		 311 aa  247  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  43.09 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  41.04 
 
 		 340 aa  246  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  42.11 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  40.86 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  39.22 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  40.59 
 
 		 323 aa  245  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  41.12 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  42.53 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  40.07 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  41.86 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  38.56 
 
 		 318 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 312 aa  241  7.999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  41.1 
 
 		 309 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  39.09 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  42.38 
 
 		 304 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  39.74 
 
 		 318 aa  238  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  39.09 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  39.09 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  39.09 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  39.09 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  39.09 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  39.09 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  39.74 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  39.09 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  41.12 
 
 		 332 aa  235  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  39.74 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  41.28 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  43.32 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  38.94 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  38.36 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  38.36 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 320 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  40.21 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  40.26 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  41.55 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.8 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  39.39 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  39.34 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  38.83 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  40.38 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  41.16 
 
 		 313 aa  225  8e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  39.06 
 
 		 317 aa  225  8e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  40.66 
 
 		 334 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  39.16 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  38.61 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  41.04 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  37.91 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  36.84 
 
 		 310 aa  221  9e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  38.36 
 
 		 310 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  38.56 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  40.65 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  39.09 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  41.42 
 
 		 361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  39.43 
 
 		 332 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  40.94 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  40.94 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  40.94 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  40.52 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  37.79 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  38.8 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 327 aa  218  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  39.8 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  40.92 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  40.62 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  40.62 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  37.99 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  36.48 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  37.25 
 
 		 409 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  38.96 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  39.43 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  39.69 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  40.66 
 
 		 303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  39.61 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  39.61 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  39.61 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  39.27 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  40.31 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  39.03 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  37.25 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  39.18 
 
 		 321 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  39.61 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  39.38 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  39.38 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  39.38 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>