More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1709 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  54.13 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 304 aa  305  7e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  51.5 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  48.38 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  50 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  47.51 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  48.54 
 
 		 308 aa  288  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  47.7 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  45.87 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  45.87 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  47.04 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  44.55 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  46.77 
 
 		 409 aa  275  6e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 396 aa  275  9e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  46.3 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  45.78 
 
 		 315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  48.04 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  48.04 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  47.71 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  47.35 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  44.66 
 
 		 340 aa  264  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  45.13 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  45.85 
 
 		 308 aa  265  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  46.23 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  45.19 
 
 		 318 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  48.62 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  43.77 
 
 		 318 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  43.59 
 
 		 318 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  43.59 
 
 		 318 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  43.59 
 
 		 318 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  43.77 
 
 		 318 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  43.59 
 
 		 318 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  46.86 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  43.97 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.97 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.97 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  44.01 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 304 aa  260  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  47.1 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  46.89 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  45.03 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  43.32 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  44.05 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.6 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  44.05 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  43.51 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  46.15 
 
 		 317 aa  251  8.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  43.93 
 
 		 307 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  45.45 
 
 		 308 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  44.37 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  44.77 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  44.12 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  44.63 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  43.32 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  49.63 
 
 		 306 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  44.12 
 
 		 317 aa  249  6e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  40.72 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  43.75 
 
 		 348 aa  248  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  43.51 
 
 		 318 aa  248  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  43.18 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  45.1 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  43.97 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  44.22 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  47.28 
 
 		 325 aa  247  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  44.22 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  43.92 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  44.22 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 		 427 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.87 
 
 		 407 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  43.65 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.28 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  43.42 
 
 		 306 aa  244  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  43.46 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  43.65 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  44.14 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  41.61 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.72 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  46.29 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  43.18 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  42.67 
 
 		 332 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  45.1 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  43.71 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  44.84 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  42.57 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  41.37 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  42.9 
 
 		 310 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2066  thioredoxin reductase (NADPH)  42.96 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  42.43 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  43.49 
 
 		 361 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  41.39 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  46.05 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  43.09 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  42.47 
 
 		 313 aa  235  6e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  40.85 
 
 		 310 aa  235  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  42.86 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  43.05 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  44.37 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>