More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2436 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
312 aa  627  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
312 aa  627  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.41 
 
 
427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  46.53 
 
 
304 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  42.72 
 
 
323 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  45.19 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  45.1 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  44.67 
 
 
309 aa  252  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  43.23 
 
 
306 aa  251  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  42.31 
 
 
311 aa  251  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  44.77 
 
 
317 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.91 
 
 
306 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  42.11 
 
 
309 aa  246  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  43.13 
 
 
317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  43.28 
 
 
318 aa  245  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  43.28 
 
 
321 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.28 
 
 
321 aa  245  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.28 
 
 
321 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  43.28 
 
 
318 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  43.28 
 
 
318 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  43.28 
 
 
318 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  45.13 
 
 
318 aa  244  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  42.62 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  42.43 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  44.59 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  42.62 
 
 
318 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  45.87 
 
 
308 aa  242  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1203  thioredoxin reductase  39.22 
 
 
305 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0940141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  42.26 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  41.12 
 
 
311 aa  241  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.77 
 
 
555 aa  241  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  42.31 
 
 
318 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  41.58 
 
 
310 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  41.18 
 
 
319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  44.22 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  42.86 
 
 
340 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  42.31 
 
 
316 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  40.4 
 
 
396 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  41.78 
 
 
333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  41.78 
 
 
333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  41.88 
 
 
409 aa  236  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  41.78 
 
 
333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  43.42 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  42.68 
 
 
345 aa  235  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  40.79 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  42 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  42.86 
 
 
311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  44.05 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  41.33 
 
 
306 aa  232  6e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  41.33 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  43.32 
 
 
313 aa  231  8.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2556  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.33 
 
 
305 aa  231  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.51858  normal  0.0789528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  40 
 
 
336 aa  231  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  41.69 
 
 
319 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.52 
 
 
579 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  43.31 
 
 
327 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40 
 
 
331 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  41.1 
 
 
310 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  40.38 
 
 
308 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  40.98 
 
 
320 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  39.34 
 
 
332 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  39.34 
 
 
308 aa  228  7e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
312 aa  228  9e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  39.03 
 
 
330 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.81 
 
 
326 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  40.91 
 
 
311 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  40.91 
 
 
311 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
310 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.26 
 
 
556 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  42.24 
 
 
309 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  41.97 
 
 
310 aa  227  2e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  39.34 
 
 
333 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  41.03 
 
 
324 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  40.07 
 
 
318 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  43.14 
 
 
312 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  41.42 
 
 
555 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  38.96 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  39.94 
 
 
323 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  42.86 
 
 
324 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  39.94 
 
 
323 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.39 
 
 
551 aa  225  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  40.85 
 
 
348 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.07 
 
 
332 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  41.26 
 
 
313 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  41.97 
 
 
308 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  41.72 
 
 
324 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  39.27 
 
 
331 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  41.56 
 
 
334 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  40.07 
 
 
310 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
456 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  38.64 
 
 
323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  40.4 
 
 
327 aa  222  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 
407 aa  221  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  40.45 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  39.87 
 
 
569 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  39.47 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  42.63 
 
 
317 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  39.2 
 
 
304 aa  220  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  41.78 
 
 
304 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>