More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0845 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0845  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
312 aa  630  1e-180  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.86 
 
 
314 aa  229  4e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  41.08 
 
 
402 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  37.71 
 
 
395 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.93 
 
 
326 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0649931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.36 
 
 
523 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  39.33 
 
 
320 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0047  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.41 
 
 
512 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36 
 
 
529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  37.87 
 
 
383 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.88 
 
 
560 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  38.26 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.88 
 
 
526 aa  195  9e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0449918  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  38.08 
 
 
319 aa  195  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  37.54 
 
 
304 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  40.28 
 
 
601 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0439  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36.71 
 
 
507 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00965821  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0428  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36.71 
 
 
507 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.273089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.91 
 
 
509 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2044  alkyl hydroperoxide reductase subunit  38.71 
 
 
622 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  37.09 
 
 
313 aa  193  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0756  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.71 
 
 
535 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0666  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  38.71 
 
 
535 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.44 
 
 
525 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  35.64 
 
 
323 aa  192  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  37.87 
 
 
321 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.08 
 
 
532 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  38.08 
 
 
550 aa  192  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.08 
 
 
519 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  36.21 
 
 
318 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  36.45 
 
 
318 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2518  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.57 
 
 
509 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  35.29 
 
 
335 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.08 
 
 
533 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  37.09 
 
 
310 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  36.12 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  36.12 
 
 
321 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.12 
 
 
321 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.12 
 
 
321 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
311 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
311 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  36.12 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  36.12 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.08 
 
 
533 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.08 
 
 
533 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.53 
 
 
548 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  36.12 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  36.45 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0142  thioredoxin-disulfide reductase  40.98 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.02 
 
 
532 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  36.45 
 
 
318 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  39.61 
 
 
324 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.31 
 
 
532 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0182  thioredoxin-disulfide reductase  40.66 
 
 
312 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.68776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  37.37 
 
 
308 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.73 
 
 
532 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  37.24 
 
 
525 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  36.09 
 
 
318 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  37.63 
 
 
304 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  37.29 
 
 
311 aa  188  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.64 
 
 
579 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  38.74 
 
 
326 aa  188  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  38.51 
 
 
323 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1376  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.38 
 
 
522 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  36.18 
 
 
323 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  38.28 
 
 
309 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  36.73 
 
 
311 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  37.42 
 
 
321 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.08 
 
 
551 aa  186  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0059  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.84 
 
 
507 aa  186  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.492285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  34.11 
 
 
312 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  38.96 
 
 
324 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  34.11 
 
 
317 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  37.09 
 
 
343 aa  186  6e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3453  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.03 
 
 
522 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455545  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  35.12 
 
 
335 aa  185  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.61 
 
 
316 aa  185  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  37.17 
 
 
306 aa  185  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1795  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.03 
 
 
525 aa  185  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114206  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5402  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.46 
 
 
530 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000100097  normal  0.196114 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  35.57 
 
 
308 aa  185  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.16 
 
 
520 aa  185  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  40 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  34.33 
 
 
510 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  36.09 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1206  AhpF  38.46 
 
 
530 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001914  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  36.42 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  40.33 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  37.25 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  37.75 
 
 
316 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0619  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.68 
 
 
515 aa  182  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.633675 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  36.09 
 
 
311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  36.86 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  36.7 
 
 
391 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2074  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.28 
 
 
525 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.113135 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3656  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.68 
 
 
530 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  35.76 
 
 
323 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  35.76 
 
 
323 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04590  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36.3 
 
 
530 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>