More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0142 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0142  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 312 aa  634    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0182  thioredoxin-disulfide reductase  98.72 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.68776  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  98.08 
 
 		 312 aa  624  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  87.5 
 
 		 313 aa  567  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0296  thioredoxin-disulfide reductase  82.11 
 
 		 314 aa  518  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  75.96 
 
 		 312 aa  497  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0172  thioredoxin reductase  70.45 
 
 		 310 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454317  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1140  thioredoxin-disulfide reductase  76.04 
 
 		 312 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0838  thioredoxin-disulfide reductase  74.12 
 
 		 312 aa  456  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1869  thioredoxin reductase  67.52 
 
 		 314 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0723907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  42.58 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  41.88 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  44.23 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  41.16 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  42.39 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  42.68 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  42.12 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  42.77 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  41.03 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  39.35 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  39.74 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  40.71 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  42.14 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  42.14 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  42.14 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  42.14 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  41.75 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  40.19 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  40.19 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  40.19 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  41.96 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  42.14 
 
 		 316 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  40.32 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  41.37 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  42.14 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  41.88 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40.45 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  41.08 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.91 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  39.31 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  38.44 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  40.45 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  40.32 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  40.32 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  40.97 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  41.64 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  39.42 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  39.18 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  40.63 
 
 		 318 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 316 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  41.1 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  39.61 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  39.35 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  40.76 
 
 		 319 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  39.43 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  40 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  39.18 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  38.64 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  39.18 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  39.43 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  39.26 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  39.18 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  40.88 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  39.57 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  40.81 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  39.69 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  40.65 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  38.96 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  40.63 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  38.98 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  39.56 
 
 		 318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  39.12 
 
 		 317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  38.98 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  38.26 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  39.08 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  39.37 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  39.12 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  37.38 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  39.81 
 
 		 317 aa  212  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  39.37 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  40 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  41.16 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  39.43 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  39.31 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  39.63 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  40 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  39.5 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  40.13 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  41.03 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 332 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  38.99 
 
 		 320 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  38.26 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  38.83 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  40.19 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>